B2B平台无法靠烧钱补贴换来客户粘性，也烧不起；
平台价格无法真正透明（为避免同行压价抢货，以及不同量级的客户对价格的要求并不一样，还有线上定价与原有线下销售价格体系的冲突）；
用户习惯还需要较长时间改变，例如客户操作人员不愿把企业ERP系统中已有的信息到货代系统平台上再次录入一遍，仍然习惯于通过邮件或QQ发送托书booking；
对于撮合式平台来说，其最大的价值在于导流，然而撮合式平台又最容易发生一次性交易，即一旦交易成功且客户认可了这个供应商的服务，后续的业务就完全可以直接对接，没有必要再通过平台了。除非平台拥有某种核心价值，让交易双方不能轻易离开，类似支付宝之于淘宝；
打造大一统的操作平台既不现实也没有必要，从整个供应链的角度来看，可能涉及的系统至少包括贸易管理系统、订单管理系统、货代操作系统、运输管理系统、仓储管理系统、报关系统等。每个系统的侧重点各异，而不同系统之间的信息，是按操作流程的时间先后顺序，由不同环节分别产生或输入，环环相扣形成操作链，彼此无法相互取代。对于同一票货物，即使部分内容可以共享，但仍然面临主分单信息的不同、中英文信息切换（提单、舱单）等难题，系统和系统之间缺乏有效对接；
所谓的信息孤岛大多数是由于政府部门及行业主管机构（海关、商检、港口、码头、船公司等）之间缺乏统一协调所致，即不是没有信息，而是信息过于分散。如果不能自上而下地开放信息接口，靠平台企业自己很难彻底打通，而通过人工方式虽然也可以实现货物运输状态的可视化，对客户来说也具备一定的价值，但从整个供应链的角度，效率并没有得到有效提高；
运价和舱位最终是被船公司/航空公司控制的，货代平台的定价等运营策略不能影响到他们的利益，否则必然会遭到无情封杀；另一方面，船公司推出直接在线订舱平台已是大势所趋，马士基、CMA等公司已经走在了市场的前面，仅以在线价格展示、比价、网上订舱为平台卖点将失去竞争力；
货代平台未来的发展方向就是做配套，提供供应链综合解决方案、门到门、仓储分拣、供应链金融等增值服务，尤其在现阶段，中小进出口企业的贷款难、贷款贵问题是客户的更大痛点，适合行业特点的供应链金融模式仍在摸索中。